A Pandemic: Rising Tide rendhagyó módon nem betegségek, hanem maga az anyatermészet ellen megy. Hollandiában járunk az ipari forradalom hajnalán és fontos feladatunk van; a vízszint alatt lévő országot meg kell védeni az emelkedő Északi-tengertől. Ehhez hidraulikus rendszereket kell építeni és elég ideig elvezetni a vizet a megfelelő helyekre, hogy ezt végbe is tudjuk vinni. Fontos előre megjósolni a víz mozgását és a már előző Pandemic játékokból ismert víruskockákat (melyek most kék vízkockák lesznek) időben semlegesíteni mielőtt láncreakció szerűen elöntik a vidéket.
